RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333090.4

TSKU-201, Transcript of tsukushi, small leucine rich proteoglycan, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSKU, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKU-201ENST00000333090 DCLK2Q8N568 766 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 FAM167AQ96KS9 214 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ACSS2Q9NR19 701 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TRIP11Q15643 1979 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RLFQ13129 1914 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CFLARO15519 480 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TMCC1O94876 653 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GTF2A2P52657 109 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TTC30AQ86WT1 665 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RNF148Q8N7C7 305 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MOCOSQ96EN8 888 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DGKIO75912 1065 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PIK3R1P27986 724 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CLCN3P51790 818 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PAOXQ6QHF9 649 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 VPS33BQ9H267 617 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 THRAP10827 490 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ABCG1P45844 678 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PKNOX1P55347 436 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 INCA1Q0VD86 236 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DSELQ8IZU8 1212 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 KYQ8NBH2 561 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RAB26Q9ULW5 256 aa24.17■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GOT1P17174 413 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 NAB1Q13506 487 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ADGRE1Q14246 886 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GALNT4Q8N4A0 578 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CERS2Q96G23 380 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TNFAIP8O95379 198 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MYBPC1Q00872 1141 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 C16orf89Q6UX73 402 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ACOT1Q86TX2 421 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GGA3Q9NZ52 723 aa24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 AMHP03971 560 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 POLBP06746 335 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GLDCP23378 1020 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PSMB4P28070 264 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DLG2Q15700 870 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MYLK3Q32MK0 819 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 METTL7BQ6UX53 244 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CCDC185Q8N715 623 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ADAM32Q8TC27 787 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RNF103O00237 685 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TOMM70O94826 608 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 EPHA3P29320 983 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 IRF9Q00978 393 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 OLIG2Q13516 323 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CPNE1Q99829 537 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RIMS3Q9UJD0 308 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 LCTP09848 1927 aa24.15■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.14■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZNF487B1APH4 448 aa24.14■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GABBR2O75899 941 aa24.14■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CHRNGP07510 517 aa24.14■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 LILRA2Q8N149 483 aa24.14■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 G3V2L1 256 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms