RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 GANCQ8TET4 914 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 SHC3Q92529 594 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 THAP9Q9H5L6 903 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 SCML1Q9UN30 329 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 ITPR1Q14643 2758 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 H0Y8X5 98 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 KCNK3O14649 394 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 ASLP04424 464 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 CSKP41240 450 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 GRK6P43250 576 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 MDM1Q8TC05 714 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.83■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 KNL1Q8NG31 2342 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGA12O60330 932 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SIN3BO75182 1162 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 APOEP02649 317 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 IGHV4-34P06331 123 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CTSKP43235 329 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CDH18Q13634 790 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 TNFSF14O43557 240 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 IGLV3-25P01717 112 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 TAF5Q15542 800 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CST6Q15828 149 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 DCAF6Q58WW2 860 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 FSCBQ5H9T9 825 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 KDM1BQ8NB78 822 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 BAHCC1Q9P281 2608 aa21.81■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PP55 124 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PPC4 97 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MID1O15344 667 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 GALCP54803 685 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 C21orf59P57076 290 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 IL9RQ01113 521 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PTK2Q05397 1052 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 ARID5BQ14865 1188 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MAN2A1Q16706 1144 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PASD1Q8IV76 773 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 LGI2Q8N0V4 545 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SLC6A18Q96N87 628 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CPXM1Q96SM3 734 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SIX2Q9NPC8 291 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.8■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 VILLO15195 856 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 DFNA5O60443 496 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MOCS3O95396 460 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 GLI1P08151 1106 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms