RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 MYLK3Q32MK0 819 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 TBCBQ99426 244 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 A0A0A0MRY4 1105 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 CFLARO15519 480 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 PIK3R1P27986 724 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 DPYSL2Q16555 572 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 LRRC8BQ6P9F7 803 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 ZFP28Q8NHY6 868 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 MARK4Q96L34 752 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 SPATA13Q96N96 652 aa25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 IRF6O14896 467 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 ATP9BO43861 1147 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 PGAM1P18669 254 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 DPP6P42658 865 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 GALNT4Q8N4A0 578 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.89■■□□□ 1.74
SENP3-201ENST00000321337 MFSD11O43934 449 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GLDCP23378 1020 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 EPHA3P29320 983 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RPL5P46777 297 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 INCA1Q0VD86 236 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 TMEM198Q66K66 360 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 HACL1Q9UJ83 578 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa25.89■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 DSELQ8IZU8 1212 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 EPB41L1Q9H4G0 881 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PICK1Q9NRD5 415 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RNF19AQ9NV58 838 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 STK39Q9UEW8 545 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RNF103O00237 685 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PPEF2O14830 753 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PCSK6P29122 969 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PKDCCQ504Y2 493 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 DNERQ8NFT8 737 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 TCF7L2Q9NQB0 619 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GGA3Q9NZ52 723 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RIMS3Q9UJD0 308 aa25.88■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 MX2P20592 715 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 CEACAM7Q14002 265 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 MAP7Q14244 749 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 FSCBQ5H9T9 825 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 C4orf22Q6V702 233 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GALNT8Q9NY28 637 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 TXNDC16Q9P2K2 825 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 P4HA1P13674 534 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 FLOT2Q14254 428 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 METTL7BQ6UX53 244 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 FAM156AQ8NDB6 213 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RCN3Q96D15 328 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 CERS2Q96G23 380 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PHF12Q96QT6 1004 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PKP2Q99959 881 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GP5P40197 560 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 RGS2P41220 211 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 IGBP1P78318 339 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 TNFAIP1Q13829 316 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 ADGRE1Q14246 886 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 INSCQ1MX18 579 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 COPS5Q92905 334 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 P2RY11Q96G91 374 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GPR20Q99678 358 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PTTG2Q9NZH5 202 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 PRDX6P30041 224 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 STRA8Q7Z7C7 330 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 TMEM110Q86TL2 294 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 LRGUKQ96M69 825 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 AGAP3Q96P47 875 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SENP3-201ENST00000321337 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms