RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 OPHN1O60890 802 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 WSCD1Q658N2 575 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 PYDC1Q8WXC3 89 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-201ENST00000311626 ATP2A3Q93084 1043 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 PHC3Q8NDX5 983 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-201ENST00000311626 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 ZFP42Q96MM3 310 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 DCDC2Q9UHG0 476 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-201ENST00000311626 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.97■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 PDK1Q15118 436 aa25.96■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 KCNK16Q96T55 309 aa25.96■■□□□ 1.75
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HOXB3-201ENST00000311626 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-201ENST00000311626 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.95■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 RNF220Q5VTB9 566 aa25.95■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 PPP4R1Q8TF05 950 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 SOX13Q9UN79 622 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 CPA3P15088 417 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 IZUMO2Q6UXV1 221 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 CYS1Q717R9 158 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 GP5P40197 560 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF781Q8N8C0 355 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXB3-201ENST00000311626 PIDD1Q9HB75 910 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 TREHO43280 583 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 CACNA2D1P54289 1103 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 PDPK2PQ6A1A2 396 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 EDEM1Q92611 657 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF560Q96MR9 790 aa25.93■■□□□ 1.74
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