RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 PI15O43692 258 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 SPOPO43791 374 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 AOC1P19801 751 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 COMTP21964 271 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 EPHB2P29323 1055 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CD70P32970 193 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 SLC1A1P43005 524 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 SEC13P55735 322 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 GEN1Q17RS7 908 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DGKKQ5KSL6 1271 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ARTNQ5T4W7 220 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DAAM2Q86T65 1068 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL6Q8N531 539 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TEKT4Q8WW24 435 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 GGA2Q9UJY4 613 aa23■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 K7EQS6 105 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 TNNT1P13805 278 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 TPI1P60174 286 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 LMAN2Q12907 356 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA3BQ13214 749 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 FZD5Q13467 585 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 A0A0A0MRY4 1105 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 PRRT4C9JH25 899 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KRT86O43790 486 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 GPR37L1O60883 481 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 RNF40O75150 1001 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KRT7P08729 469 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 OR1E1P30953 314 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO43Q4G163 708 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 NEU3Q9UQ49 428 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ANTXRLA6NF34 631 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 MOCS3O95396 460 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 RHOCP08134 193 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 RHOQP17081 205 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 GOT1P17174 413 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TNFRSF4P43489 277 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 NUMBP49757 651 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KRT81Q14533 505 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DPYSL2Q16555 572 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZS52 159 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 AHI1Q8N157 1196 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CIPCQ9C0C6 399 aa22.98■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 PRR33A8MZF0 331 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DAPK3O43293 454 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ARL4AP40617 200 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CSKP41240 450 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CDH6P55285 790 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf27AQ580R0 203 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 EMC10Q5UCC4 262 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 CLDN23Q96B33 292 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 DNAI1Q9UI46 699 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.97■■□□□ 1.27
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HOXD4-201ENST00000306324 HOXC13P31276 330 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 HTR7P34969 479 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TIE1P35590 1138 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 OXCT1P55809 520 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 FUT11Q495W5 492 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM215Q68D42 235 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP14Q86W24 1093 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD6Q8NC69 237 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 LMLNQ96KR4 655 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 MUC3BQ9H195 1237 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD4-201ENST00000306324 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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