RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269844.4

PRDM15-201, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM15, Length 4,881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-201ENST00000269844 SFT2D3Q587I9 215 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RRM2BQ7LG56 351 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 KRT74Q7RTS7 529 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 STARD8Q92502 1023 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 LRRC19Q9H756 370 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 A0A1W2PPW3 197 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TIMM44O43615 452 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PLOD3O60568 738 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RAP1GAPP47736 663 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PRKAA2P54646 552 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CDH15P55291 814 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF682O95780 498 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ETS1P14921 441 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PDGFRAP16234 1089 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PTPN7P35236 360 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 CD151P48509 253 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 FAM167AQ96KS9 214 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ASB3Q9Y575 518 aa14.71□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ISPDA4D126 451 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PWP1Q13610 501 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF677Q86XU0 584 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TTLL6Q8N841 843 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ITFG1Q8TB96 612 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 H0Y858 1186 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 CYP11B1P15538 503 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 GNAZP19086 355 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 POU1F1P28069 291 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 MARCKSL1P49006 195 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 SULT2A1Q06520 285 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TNK2Q07912 1038 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 MTERF2Q49AM1 385 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF276Q8N554 614 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 EGFL8Q99944 293 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 NEK6Q9HC98 313 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 AKAP3O75969 853 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 UGT2B4P06133 528 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 RASA1P20936 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 FUT4P22083 530 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 CRABP2P29373 138 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 GPD2P43304 727 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ENPEPQ07075 957 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 VSTM1Q6UX27 236 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 SEMA4DQ92854 862 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 SSNA1O43805 119 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 HUS1O60921 280 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TGM2P21980 687 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 TTC39CQ8N584 583 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF560Q96MR9 790 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 C3orf18Q9UK00 162 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 HAT1O14929 419 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 KATNA1O75449 491 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 MIER2Q8N344 545 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 CCDC126Q96EE4 140 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 COA1Q9GZY4 146 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-201ENST00000269844 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms