RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 WDR27A2RRH5 827 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 VPS26AO75436 327 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CCNE2O96020 404 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CRABP2P29373 138 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 VEPH1Q14D04 833 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 TGFBR2P37173 567 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 C2CD6Q53TS8 623 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 SENP2Q9HC62 589 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CMTM6Q9NX76 183 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CACNA1CQ13936 2221 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PDGFRBP09619 1106 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 LBPP18428 481 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 GLRBP48167 497 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 C2CD2LO14523 706 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 BCAP31P51572 246 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 STAT5BP51692 787 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PDK4Q16654 411 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 NLRP1Q9C000 1473 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PMPCBO75439 489 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 LTKP29376 864 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 NAMPTP43490 491 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TBX20Q9UMR3 447 aa7.3□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ERBB3P21860 1342 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CSNK2BP67870 215 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 EBF2Q9HAK2 575 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 GNB5O14775 395 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ADRA1DP25100 572 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CACNB3P54284 484 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 BICRALQ6AI39 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 HPDLQ96IR7 371 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.244e-6■■■□□ 16
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HERC2-201ENST00000261609 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 ASLP04424 464 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 XKR3Q5GH77 459 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CDC73Q6P1J9 531 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 KRT78Q8N1N4 520 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 EHD1Q9H4M9 534 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 PCSK1P29120 753 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.29□□□□□ -1.24
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HERC2-201ENST00000261609 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC2-201ENST00000261609 GABBR2O75899 941 aa7.29□□□□□ -1.24
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