RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 IGFBP7Q16270 282 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 BMT2Q1RMZ1 405 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.321e-8■■□□□ 12.6
SPCS1-201ENST00000233025 CRYBG2Q8N1P7 616 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf29Q8N999 325 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF516Q92618 1163 aa17.08■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FRMD3A2A2Y4 597 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ADORA2BP29275 332 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CD70P32970 193 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD8P48556 350 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SGSHP51688 502 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TRPC3Q13507 836 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD6Q15008 389 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBR1Q16650 682 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PLD4Q96BZ4 506 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 STK17AQ9UEE5 414 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 DMTF1Q9Y222 760 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CA5BQ9Y2D0 317 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 USP3Q9Y6I4 520 aa17.07■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MED13Q9UHV7 2174 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 UBE4BO95155 1302 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 THEGLP0DJG4 465 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 DRD3P35462 400 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT1P36639 197 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PDX1P52945 283 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF445P59923 1031 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CYP24A1Q07973 514 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TGIF1Q15583 401 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF699Q32M78 642 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ELMO3Q96BJ8 720 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 LMLNQ96KR4 655 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1586Q9HCI6 787 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL11Q9NVR0 708 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 STOML2Q9UJZ1 356 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM6Q9BX84 2022 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A8A0AV02 714 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ALPPL2P10696 532 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 NDST1P52848 882 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 STAT4Q14765 748 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CLCA4Q14CN2 919 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TTC17Q96AE7 1141 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ARRDC3Q96B67 414 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CLIC6Q96NY7 704 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FAM129BQ96TA1 746 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ACSL6Q9UKU0 697 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SRPK3Q9UPE1 567 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 UNC13CQ8NB66 2214 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087X0B3 334 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 K7ESM1 405 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TCEA3O75764 348 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ADH1BP00325 375 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PDCP20941 246 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SYT1P21579 422 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 C5AR1P21730 350 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 HOXD13P35453 343 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 KCNMA1Q12791 1236 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM69Q86WT6 500 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 RDH13Q8NBN7 331 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 HTR3CQ8WXA8 447 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 EVA1BQ9NVM1 165 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 WDR70Q9NW82 654 aa17.04■□□□□ 0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms