RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RASSF10A6NK89 507 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LIASO43766 372 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MMRN1Q13201 1228 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CERS2Q96G23 380 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FZD8Q9H461 694 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TUSC3Q13454 348 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HGSNATQ68CP4 663 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KRT82Q9NSB4 513 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ADA2Q9NZK5 511 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CCNCP24863 283 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 AKT1P31749 480 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CLCN2P51788 898 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UBA3Q8TBC4 463 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 WNK4Q96J92 1243 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDT1Q9H211 546 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SCN3BQ9NY72 215 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLC26A3P40879 764 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDC16Q13042 620 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DPYSL3Q14195 570 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OOSP2Q86WS3 158 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NPHS2Q9NP85 383 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GUCY1A3Q02108 690 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SELENONQ9NZV5 590 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.46□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IRF6O14896 467 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TRIM13O60858 407 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TYMPP19971 482 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MAPKAPK2P49137 400 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 EME1Q96AY2 570 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF599Q96NL3 588 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CLDN11O75508 207 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ARIH2O95376 493 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 L1CAMP32004 1257 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SPOCK2Q92563 424 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SENP8Q96LD8 212 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 USP1O94782 785 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ADH1AP07327 375 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CPA3P15088 417 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RPS6KA3P51812 740 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 OSMRQ99650 979 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 WDR41Q9HAD4 459 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SETD4Q9NVD3 440 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 KLHL33A6NCF5 533 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 PEX19P40855 299 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MON1BQ7L1V2 547 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 DDIASQ8IXT1 998 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ECSITQ9BQ95 431 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RNF112Q9ULX5 631 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 FSBPO95073 299 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CNTN1Q12860 1018 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.46□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CYS1Q717R9 158 aa6.46□□□□□ -1.38
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