RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 AGAP3Q96P47 875 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PPCSQ9HAB8 311 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SLC12A8A0AV02 714 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 RASA4BC9J798 803 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 RASA4O43374 803 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CDK16Q00536 496 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 DSG1Q02413 1049 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM199Q8N511 208 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC39Q96DD0 335 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PAFAH2Q99487 392 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TLR5O60602 858 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LBX1P52954 281 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SEC24CP53992 1094 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 COG7P83436 770 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CYTH2Q99418 400 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 FETUBQ9UGM5 382 aa23.73■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TMEM120BA0PK00 339 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SPAG6O75602 509 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 BRAFP15056 766 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LAG3P18627 525 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZSCAN26Q16670 478 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TEX44Q53QW1 395 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 GORASP1Q9BQQ3 440 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SLC39A8Q9C0K1 460 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 EPN3Q9H201 632 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 EFCAB14O75071 495 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ABLIM3O94929 683 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 JCHAINP01591 159 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 KRT15P19012 456 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SPARCL1Q14515 664 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TRABD2AQ86V40 505 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LZTR1Q8N653 840 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 YME1L1Q96TA2 773 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SPG21Q9NZD8 308 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.72■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJB2P25686 324 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 MSH2P43246 934 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 NR1H3Q13133 447 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 RASA2Q15283 850 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 DPF3Q92784 378 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 MLNP12872 115 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 USP33Q8TEY7 942 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 CENPTQ96BT3 561 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 VAT1Q99536 393 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 GBA3Q9H227 469 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.71■■□□□ 1.39
GNPTG-201ENST00000204679 IGLV3-27P01718 113 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 URODP06132 367 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 NFKB1P19838 968 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 CCNCP24863 283 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 STX2P32856 288 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 CRADDP78560 199 aa23.7■■□□□ 1.38
GNPTG-201ENST00000204679 OLIG2Q13516 323 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms