RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 EFEMP1Q12805 493 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA17Q96L03 361 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 NEU3Q9UQ49 428 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D4O60343 1298 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKCHP24723 683 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXC13P31276 330 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TUBP50607 506 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF33AQ06730 810 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP4Q13115 394 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX44Q53QW1 395 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZMYND15Q9H091 742 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 GBA3Q9H227 469 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM92AA1XBS5 289 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 E9PAM4 449 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MT-ND3P03897 115 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF10Q12962 218 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MANEALQ5VSG8 457 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNJLQ8IV13 435 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.55■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR27A2RRH5 827 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB17Q13105 803 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SPARCL1Q14515 664 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 LGSNQ5TDP6 509 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEB18Q96M61 343 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 COMMD8Q9NX08 183 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MGAT1P26572 445 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 USP41Q3LFD5 358 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MZB1Q8WU39 189 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC39A13Q96H72 371 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf74Q96LT6 269 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 NAT9Q9BTE0 207 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PLAC1Q9HBJ0 212 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 GGA2Q9UJY4 613 aa24.54■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT37O76014 449 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 AP2A1O95782 977 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 JCHAINP01591 159 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNCP24863 283 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPSAP1Q14558 356 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CABS1Q96KC9 395 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM169AQ9Y6X4 670 aa24.53■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TYROBPO43914 113 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0754O94854 1291 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ZWINTO95229 277 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 NFKB1P19838 968 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CRADDP78560 199 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MIB1Q86YT6 1006 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TEKT5Q96M29 485 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 VNN2O95498 520 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 C1QAP02745 245 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PGAM1P18669 254 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMD5Q16401 504 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 HHATQ5VTY9 493 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 GIPC2Q8TF65 315 aa24.52■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TSGA13Q96PP4 275 aa24.52■■□□□ 1.52
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