RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capn9Q9D805 690 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam3aQ9D8T0 230 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NfkbizQ9EST8 728 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IvdQ9JHI5 424 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc7a9Q9QXA6 487 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr414E9Q5P8 317 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LipiF6YQT7 476 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb9O08797 374 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab23P35288 237 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl6P41183 707 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc1a2P43006 572 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igfbp2P47877 305 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx2Q60707 711 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sim2Q61079 657 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints6Q6PCM2 883 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bola2Q8BGS2 86 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4921504E06RikQ8CET2 560 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr847Q8VFF4 312 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srgap2Q91Z67 1071 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim12aQ99PQ1 284 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mgrn1Q9D074 532 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrps33Q9D2R8 106 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubqln5Q9D4I8 510 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc33Q9D6K7 262 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ovca2Q9D7E3 225 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox3fA2ANE1 215 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm14496K7N5U4 849 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AladP10518 330 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gad1P48318 593 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TubP50586 505 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zyg11bQ3UFS0 744 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm29609Q3UU56 907 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pla2g4dQ50L43 825 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GkQ64516 559 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf280cQ6P3Y5 742 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpatch2lQ6PE65 482 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Epn1Q80VP1 575 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf3c2Q8BL74 907 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam149aQ8CFV2 787 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PvrQ8K094 408 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ugp2Q91ZJ5 508 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Thap12Q9CUX1 758 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PyglQ9ET01 850 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfu1Q9QZ23 255 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MttpO08601 894 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam47cQ14BE7 430 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam8a1Q3URQ4 399 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tfap2bQ61313 459 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde1aQ61481 565 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il10raQ61727 575 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hs3st2Q673U1 367 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl25Q6NXH8 597 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf728Q6P5C7 752 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RbakQ8BQC8 711 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam161aQ8QZV6 448 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctage5Q8R311 779 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asz1Q8VD46 475 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Egfl6Q9JJZ5 550 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppm1dQ9QZ67 598 aa23.37■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tldc2A2ACG1 198 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp51B1AY15 661 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm20671F6TVX7 576 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arfip1G5E8V9 373 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gucy1b3O54865 620 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xirp1O70373 1129 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gdap1O88741 358 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gabrg2P22723 474 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrkchP23298 683 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem232Q5K6N0 675 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zkscan4Q5SZT6 480 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndrg1Q62433 394 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints2Q80UK8 1198 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Parp9Q8CAS9 866 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhb1Q91Y08 818 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r84D3YWE3 849 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp850J3QPC5 689 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Birc5O70201 140 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LmnaP48678 665 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CamkmtQ3U2J5 323 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HiraQ61666 1015 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RhocQ62159 193 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif11Q6P9P6 1052 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Armc12Q80X86 340 aa23.35■■□□□ 1.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdk17Q8K0D0 523 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.2 ms