RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	COPS2	P61201	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	IFT88	Q13099	833 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TEAD2	Q15562	447 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM189A1	O60320	539 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PMPCB	O75439	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GAS8	O95995	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF30	P17039	623 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	CEBPB	P17676	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ARL4A	P40617	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC1A1	P43005	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TBX4	P57082	545 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	DHX58	Q96C10	678 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091		H0Y858	1186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SOCS5	O75159	536 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	KAT7	O95251	611 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	LTF	P02788	710 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	HBQ1	P09105	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	KRT9	P35527	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	P2RY2	P41231	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GYS2	P54840	703 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GRM2	Q14416	872 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	DHCR24	Q15392	516 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	CRY1	Q16526	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	BIN1	O00499	593 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	VILL	O15195	856 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	JAK2	O60674	1132 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ERLIN1	O75477	346 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	TPPP	O94811	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	RARG	P13631	454 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	RHOQ	P17081	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SCAP	Q12770	1279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	CCIN	Q13939	588 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PDK2	Q15119	407 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091		Q6ZNB5	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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