RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FKTN	O75072	461 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PSMA2	P25787	234 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	GJC1	P36383	396 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MLH1	P40692	756 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DSC3	Q14574	896 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LPIN1	Q14693	890 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MORF4L2	Q15014	288 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC142	Q17RM4	750 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PKDCC	Q504Y2	493 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RAPH1	Q70E73	1250 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LPP	Q93052	612 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HESX1	Q9UBX0	185 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		15.74	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659		E9PBE3	544 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF623	O75123	536 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TNFAIP8	O95379	198 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TH	P07101	528 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PDGFRB	P09619	1106 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM18	P0DKX4	95 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TSHR	P16473	764 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ADRA1D	P25100	572 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	EMP3	P54852	163 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TTC30A	Q86WT1	665 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	AHI1	Q8N157	1196 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	BBS5	Q8N3I7	341 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	VPS50	Q96JG6	964 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		15.73	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ALOX15B	O15296	676 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MGEA5	O60502	916 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TCF4	P15884	667 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KLRC2	P26717	231 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	VPS41	P49754	854 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PRMT2	P55345	433 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	OXCT1	P55809	520 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LLGL1	Q15334	1064 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	USP41	Q3LFD5	358 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LHX8	Q68G74	356 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ALLC	Q8N6M5	410 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	BANP	Q8N9N5	519 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	MIOS	Q9NXC5	875 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ARL5C	A6NH57	179 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659		E5RJQ4	531 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CYB561D2	O14569	222 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HCRT	O43612	131 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RALA	P11233	206 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF24	P17028	368 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LMO2	P25791	158 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	RGS7	P49802	495 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ARL4C	P56559	192 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	EMC1	Q8N766	993 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	ITPKC	Q96DU7	683 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	BIRC8	Q96P09	236 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		15.72	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		15.72	■□□□□ 0.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms