RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CLUHO75153 1309 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRU2 124 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 EPOPA6NHQ4 379 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 WASH4PA8MWX3 477 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSL4O60488 711 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL4P12829 197 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HDCP19113 662 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PDK1Q15118 436 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL22Q6P050 247 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NETO2Q8NC67 525 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ART4Q93070 314 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 GCNAQ96QF7 691 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DRGXA6NNA5 263 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TP73O15350 636 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NCAM2O15394 837 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNN4O15554 427 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF19O95750 216 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 KLKB1P03952 638 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 POU2F2P09086 479 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM153BP0C7A2 387 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PLTPP55058 493 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM153CQ494X1 144 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP14Q86W24 1093 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 LZTR1Q8N653 840 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CAVIN3Q969G5 261 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TLE6Q9H808 572 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO7AQ13402 2215 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PFKLP17858 780 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TACR2P21452 398 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CCR2P41597 374 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC11A2P49281 568 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCOCO2Q13137 446 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP6Q16828 381 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CHSY1Q86X52 802 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 BBOF1Q8ND07 529 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF8Q969P0 613 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 LGMNQ99538 433 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP6Q9NZW5 540 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 XYLBO75191 536 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOQP17081 205 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NRLP54845 237 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A9P82251 487 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT2Q10471 571 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 GPS1Q13098 491 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 P3H1Q32P28 736 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf22Q49AR2 442 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND1CQ8IV53 801 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 LEMD2Q8NC56 503 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 WBP2Q969T9 261 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF1P10914 325 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 VAV1P15498 845 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 GJA1P17302 382 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MX2P20592 715 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A4P31645 630 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 IRAK1P51617 712 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 SHKBP1Q8TBC3 707 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR3CQ8WXA8 447 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC45Q96CN5 670 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NDFIP2Q9NV92 336 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM248Q9NWD8 314 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 CPQQ9Y646 472 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 MOSPD3O75425 235 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOP08100 348 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 NRIP1P48552 1158 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA8P53708 1063 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-215ENST00000628018 ZXDBP98169 803 aa25.58■■□□□ 1.69
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