RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621582.1

SRGAP2B-206, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, human

TSL 5

Gene SRGAP2B, Length 486 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRGAP2B-206	ENST00000621582	MFAP3L	O75121	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PAGE1	O75459	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	GJB6	O95452	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ADCY5	O95622	1261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FAM228B	P0C875	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	TACR2	P21452	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	NNMT	P40261	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	OPRD1	P41143	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CXCR3	P49682	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	NRL	P54845	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	OXCT1	P55809	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	RAB15	P59190	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	MTAP	Q13126	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FZD5	Q13467	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CCIN	Q13939	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SPA17	Q15506	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ACD	Q96AP0	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CHP1	Q99653	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRGAP2B-206	ENST00000621582	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms