RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 STAG3L1P0CL83 205 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CEP290O15078 2479 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PDSS2Q86YH6 399 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 MPP5Q8N3R9 675 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 STRA6Q9BX79 667 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CYLDQ9NQC7 956 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CRABP2P29373 138 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 IFNEQ86WN2 208 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CNPY3Q9BT09 278 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.7□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 HCRTO43612 131 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NAMPTP43490 491 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 RCN3Q96D15 328 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FAM210AQ96ND0 272 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 BFARQ9NZS9 450 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CHADO15335 359 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CYP2C9P11712 490 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 GRK2P25098 689 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 GNASQ5JWF2 1037 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 A0A088AWK7 358 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 LACTBL1A8MY62 500 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NME3Q13232 169 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PAOXQ6QHF9 649 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CYGBQ8WWM9 190 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 COG4Q9H9E3 785 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 V9GYQ6 96 aa14.69□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 OGTO15294 1046 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ERBB2P04626 1255 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 EDN1P05305 212 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CYP2F1P24903 491 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SLC18A2Q05940 514 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PTK2BQ14289 1009 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 JADE1Q6IE81 842 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 REPS2Q8NFH8 660 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ITFG2Q969R8 447 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 MOCOSQ96EN8 888 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 HPDLQ96IR7 371 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 MICAL2O94851 1124 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PGK1P00558 417 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ABCD1P33897 745 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SURF1Q15526 300 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 BOLA3Q53S33 107 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 DDI1Q8WTU0 396 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 RNF157Q96PX1 679 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 COL4A5P29400 1685 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 AMHP03971 560 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 POLBP06746 335 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 NME5P56597 212 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 KLF10Q13118 480 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
EPHB4-210ENST00000616502 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms