RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597765.1

GDF15-204, Transcript of growth differentiation factor 15, humanhuman

TSL 4

Gene GDF15, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15-204ENST00000597765 BEND5Q7L4P6 421 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 ITIH5Q86UX2 942 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 FAM72BQ86X60 149 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 ITFG1Q8TB96 612 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 ING5Q8WYH8 240 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 DNASE1L2Q92874 299 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 GKN1Q9NS71 199 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 IGF2RP11717 2491 aa14.65□□□□□ -0.06
GDF15-204ENST00000597765 LRRD1A4D1F6 860 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TM4SF5O14894 197 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TUBB4AP04350 444 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 RHOP08100 348 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 POU2F2P09086 479 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 IRF1P10914 325 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 RALAP11233 206 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CEBPBP17676 345 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ZXDBP98169 803 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TEAD2Q15562 447 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 HECTD3Q5T447 861 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 LRRC38Q5VT99 294 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SLC39A13Q96H72 371 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CARD6Q9BX69 1037 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 GDE1Q9NZC3 331 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CDC23Q9UJX2 597 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ASB3Q9Y575 518 aa14.64□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 KDELR1P24390 212 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 L1CAMP32004 1257 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CXCL12P48061 93 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 IRAK1P51617 712 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 EPHA5P54756 1037 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CDH6P55285 790 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TBX4P57082 545 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 DPYSL3Q14195 570 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 C14orf80Q86SX3 495 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ELMOD1Q8N336 334 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 NETO2Q8NC67 525 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ASAH2Q9NR71 780 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 LAMA1P25391 3075 aa14.63□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SHISA7A6NL88 538 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SOBPA7XYQ1 873 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 HRO43593 1189 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PAGE1O75459 146 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 IGLV3-27P01718 113 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PTPN2P17706 415 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ADRA1BP35368 520 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 CDKN2BP42772 138 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PSEN1P49768 467 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 C2orf54Q08AI8 447 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.62□□□□□ -0.07
GDF15-204ENST00000597765 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms