RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	EPN2	O95208	641 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ASL	P04424	464 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	NDUFV2	P19404	249 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SDC4	P31431	198 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CXCR3	P49682	368 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ENPP2	Q13822	863 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FBXL22	Q6P050	247 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	LRRC31	Q6UY01	552 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	NUP58	Q9BVL2	599 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	EML5	Q05BV3	1969 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	KRT3	P12035	628 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PDGFRA	P16234	1089 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ATP11A	P98196	1134 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FUT11	Q495W5	492 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	EMC1	Q8N766	993 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	BAP1	Q92560	729 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ADCY5	O95622	1261 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	TPM3	P06753	285 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ACADM	P11310	421 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PRKCH	P24723	683 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CREB5	Q02930	508 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	LMNB2	Q03252	620 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SLC12A1	Q13621	1099 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CDO1	Q16878	200 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PMS2CL	Q68D20	193 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SUN2	Q9UH99	717 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	HLA-E	P13747	358 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	DES	P17661	470 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	BCKDHB	P21953	392 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CSK	P41240	450 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CSRP2	Q16527	193 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FSCB	Q5H9T9	825 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF292	O60281	2723 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	AP5Z1	O43299	807 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	GGCX	P38435	758 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	NNMT	P40261	264 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FAM131B	Q86XD5	332 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	C3orf20	Q8ND61	904 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	TTC17	Q96AE7	1141 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CD248	Q9HCU0	757 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		27.78	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	NDUFS2	O75306	463 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CLDN11	O75508	207 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	MPL	P40238	635 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP8	P85298	464 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	FIGN	Q5HY92	759 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	MON1B	Q7L1V2	547 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF366	Q8N895	744 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	IGSF8	Q969P0	613 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	IQCD	Q96DY2	449 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BRD4-208	ENST00000597315	LMLN	Q96KR4	655 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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