RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 APOEP02649 317 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 CHN1P15882 459 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 GCAP28676 217 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 TBX4P57082 545 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 DUSP4Q13115 394 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP36-218ENST00000590546 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 PID1Q7Z2X4 250 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP36-218ENST00000590546 ZNF567Q8N184 647 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 NPWQ8N729 165 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP36-218ENST00000590546 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 TBK1Q9UHD2 729 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.02■■□□□ 1.28
USP36-218ENST00000590546 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP36-218ENST00000590546 TAF10Q12962 218 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.01■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 TSGA13Q96PP4 275 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 RASA4BC9J798 803 aa23.01■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 RASA4O43374 803 aa23.01■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 VNN2O95498 520 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 PTPN3P26045 913 aa23.01■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 MSH2P43246 934 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 CCNJLQ8IV13 435 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 NEU3Q9UQ49 428 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 WASH4PA8MWX3 477 aa23■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 CYP4X1Q8N118 509 aa23■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 TEX44Q53QW1 395 aa22.99■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 TPGS2Q68CL5 300 aa22.99■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 ZNF534Q76KX8 674 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 TUBP50607 506 aa22.99■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 SLC18A1P54219 525 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP36-218ENST00000590546 CYS1Q717R9 158 aa22.99■■□□□ 1.27
USP36-218ENST00000590546 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.99■■□□□ 1.27
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