RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 ABHD16AO95870 558 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 AGR2O95994 175 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MT-ND5P03915 603 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SBK3P0C264 359 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ITGB5P18084 799 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GNA11P29992 359 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK9P45984 424 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ALDH1A3P47895 512 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MEOX1P50221 254 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLC13A2Q13183 592 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SP140Q13342 867 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PFKFB4Q16877 469 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ZACNQ401N2 412 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 BLIDQ8IZY5 108 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 NUDT11Q96G61 164 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TBATAQ96M53 351 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEH1Q9H213 219 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 FAM86B1E9PN63 330 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HAS3O00219 553 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GRM6O15303 877 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TEX33O43247 280 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 FIBPO43427 364 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 EDIL3O43854 480 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ATP9AO75110 1047 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 STAM2O75886 525 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TOX4O94842 621 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RSPH10BP0C881 870 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF28P17035 718 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ICAM3P32942 547 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 THPOP40225 353 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LIMS1P48059 325 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ5P48544 419 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GUCY1B3Q02153 619 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SP4Q02446 784 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 GPM6BQ13491 265 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 BEND5Q7L4P6 421 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RPAINQ86UA6 219 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SERINC5Q86VE9 423 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 BICD2Q8TD16 824 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TBCKQ8TEA7 893 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 WASF1Q92558 559 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SEPT8Q92599 483 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MUL1Q969V5 352 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 RRN3Q9NYV6 651 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PRRT4C9JH25 899 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 NPC1O15118 1278 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ARP10275 920 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 KCNA2P16389 499 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 XBP1P17861 261 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 KRT2P35908 639 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 EPHB3P54753 998 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CEP55Q53EZ4 464 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 AFMIDQ63HM1 303 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LPPQ93052 612 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 TOP1MTQ969P6 601 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA33Q96N06 139 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 PRRX2Q99811 253 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 JADE2Q9NQC1 790 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4D-210ENST00000588972 LGALS16A8MUM7 142 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms