RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588278.1

TPGS1-202, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Gene TPGS1, Length 2,873 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-202ENST00000588278 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 RMI1Q9H9A7 625 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TMEM221A6NGB7 291 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 H7C0C1 242 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ADCY6O43306 1168 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 C1QAP02745 245 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 APRTP07741 180 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 KDELR1P24390 212 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ATP5OP48047 213 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SLC1A6P48664 564 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 IDH3AP50213 366 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.99■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 WDR81Q562E7 1941 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 AP1G1O43747 822 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TNFAIP8O95379 198 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 AMHP03971 560 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 STAG3L1P0CL83 205 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ADORA2AP29274 412 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NUDT2P50583 147 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 KCTD2Q14681 263 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 AMHR2Q16671 573 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 BTBD9Q96Q07 612 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF358Q9NW07 568 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SIX4Q9UIU6 781 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 FBXO21O94952 628 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CSPG5O95196 566 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 THRAP10827 490 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CRADDP78560 199 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 WASHC5Q12768 1159 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CCT7Q99832 543 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PKP2Q99959 881 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 THAP1Q9NVV9 213 aa15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NEMP1O14524 444 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MICAL2O94851 1124 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF286BP0CG31 522 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 GRIA1P42261 906 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 THOP1P52888 689 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NUP93Q8N1F7 819 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 NETO2Q8NC67 525 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 GIPC3Q8TF64 312 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 USP18Q9UMW8 372 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ACKR2O00590 384 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 IL1BP01584 269 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PDGFRAP16234 1089 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 RXRGP48443 463 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 PPM1JQ5JR12 505 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 LPCAT2Q7L5N7 544 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SULF1Q8IWU6 871 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 C7orf31Q8N865 590 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 JADE3Q92613 823 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MCF2LO15068 1137 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 GSRP00390 522 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 KRT7P08729 469 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 MS4A2Q01362 244 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 XYLT1Q86Y38 959 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 UBR7Q8N806 425 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SMYD1Q8NB12 490 aa15.97■□□□□ 0.15
TPGS1-202ENST00000588278 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms