RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL22	Q6P050	247 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	BNIPL	Q7Z465	357 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	EMC1	Q8N766	993 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	LOXL4	Q96JB6	756 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	LMLN	Q96KR4	655 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	SPACA7	Q96KW9	195 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	CD248	Q9HCU0	757 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ATG13-223	ENST00000577256	CKAP5	Q14008	2032 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ENDOD1	O94919	500 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MOCS3	O95396	460 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GABRG2	P18507	467 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PTPN9	P43378	593 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	OXCT1	P55809	520 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ELF2	Q15723	593 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FUT11	Q495W5	492 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KBTBD6	Q86V97	674 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TTC17	Q96AE7	1141 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SIK2	Q9H0K1	926 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF292	O60281	2723 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	LRP3	O75074	770 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ASL	P04424	464 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	P2RY2	P41231	377 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ATP11A	P98196	1134 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SLC12A1	Q13621	1099 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PLK5	Q496M5	336 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	C5orf22	Q49AR2	442 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FSCB	Q5H9T9	825 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	STRADA	Q7RTN6	431 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DCLK2	Q8N568	766 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGSF8	Q969P0	613 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	C1orf74	Q96LT6	269 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	HAPLN3	Q96S86	360 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.19	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ANKRD62	A6NC57	917 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DCLK1	O15075	740 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF217	O75362	1048 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CLDN11	O75508	207 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GJB6	O95452	261 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	EPHX1	P07099	455 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GZMA	P12544	262 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFV2	P19404	249 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	GPD1	P21695	349 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PRKCH	P24723	683 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CSK	P41240	450 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZBED6	P86452	979 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PTPRN	Q16849	979 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC14	Q49A88	953 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	LRRC31	Q6UY01	552 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FAM131B	Q86XD5	332 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM245	Q9H330	911 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	INVS	Q9Y283	1065 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		18.18	■□□□□ 0.5
ATG13-223	ENST00000577256	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		18.17	■□□□□ 0.5

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