RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 RSPH3Q86UC2 560 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GAD1Q99259 594 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 YY1AP1Q9H869 796 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 HHLA1C9JL84 531 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FAM72CH0Y354 149 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FCHO1O14526 889 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 AKR1A1P14550 325 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CCNG1P51959 295 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 INSCQ1MX18 579 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ACCSLQ4AC99 568 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 FAM72BQ86X60 149 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 IRGQQ8WZA9 623 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ATP2A3Q93084 1043 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 WWP1Q9H0M0 922 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 AP2A1O95782 977 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MX2P20592 715 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 PCSK1P29120 753 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CLCNKBP51801 687 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 STX3Q13277 289 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CES4AQ5XG92 561 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 C17orf99Q6UX52 265 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MIPEPQ99797 713 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CEP41Q9BYV8 373 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 THAP1Q9NVV9 213 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 PEX11AO75192 247 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 NCAM1P13591 858 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GP5P40197 560 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 NETO2Q8NC67 525 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 HDAC11Q96DB2 347 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CERS2Q96G23 380 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 DDIT4Q9NX09 232 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MIOSQ9NXC5 875 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 PCNTO95613 3336 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 TPP1O14773 563 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ITGA2BP08514 1039 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 USP17L7P0C7H9 530 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GRTP1Q5TC63 336 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 RASSF3Q86WH2 238 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 SCML4Q8N228 414 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 KCNK16Q96T55 309 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 VAT1Q99536 393 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CPNE1Q99829 537 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 CASS4Q9NQ75 786 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-207ENST00000565975 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 I6L893 689 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 GSRP00390 522 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 SERPINB6P35237 376 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 CXCR3P49682 368 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 GALNT2Q10471 571 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 ADAM32Q8TC27 787 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 ISL2Q96A47 359 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 EPAS1Q99814 870 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 GBA3Q9H227 469 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 ZFATQ9P243 1243 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 EMCNQ9ULC0 261 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-207ENST00000565975 KCNK1O00180 336 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms