RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPSAB1Q15661 275 aa20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 AAGABQ6PD74 315 aa20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC93AQ86WB7 457 aa20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLLPQ9Y342 182 aa20.89■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 RFPL1O75677 317 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANPEPP15144 967 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB6Q15916 424 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DGKDQ16760 1214 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAPLN3Q96S86 360 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.88■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGT1A9O60656 530 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 FKBP6O75344 327 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSH1P0DML2 217 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSH2P0DML3 217 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 NR2C2P49116 596 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DSG1Q02413 1049 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTBPQ96DY7 904 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM159BA6NKW6 160 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT38O76015 456 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYL2P10916 166 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIZQ2M2Z5 673 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 BEST2Q8NFU1 509 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ECSITQ9BQ95 431 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.87■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMPD1P23109 780 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK7P50613 346 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 AP2B1P63010 937 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 XIAPP98170 497 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMPR2Q13873 1038 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARCQ7LC44 396 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPP5Q8N3R9 675 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 C7orf31Q8N865 590 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 VCX3BQ9H321 246 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.86■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 HCRTO43612 131 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCNN1AP37088 669 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM60Q495X7 471 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPF3Q92784 378 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 OLFM3Q96PB7 478 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 MECRQ9BV79 373 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 B2RBV5 119 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 I3L4J1 428 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CIB2O75838 187 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC130P13994 396 aa20.85■□□□□ 0.93
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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