RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCZ1BP86790 482 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYL7Q01449 175 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 APBA1Q02410 837 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 BFSP1Q12934 665 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM14Q14142 442 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYBPC3Q14896 1274 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPK6Q16659 721 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRGPREQ86SM8 312 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPD1LQ8N335 351 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 C7orf31Q8N865 590 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TC2NQ8N9U0 490 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEK11Q8NG66 645 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC127Q96BQ5 260 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCHPQ9BT92 498 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAI1Q9UI46 699 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q9Y3F1 56 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM17Q9Y577 477 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANK1P16157 1881 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCSK5Q92824 1860 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC26A0AVF1 554 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 HAS3O00219 553 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EPHB6O15197 1021 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASAP2O43150 1006 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZEB2O60315 1214 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP17A1P05093 508 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASGR1P07306 291 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DLATP10515 647 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACTN1P12814 892 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC9A1P19634 815 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGS2P35354 604 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT9P35527 623 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGFALSP35858 605 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GCLMP48507 274 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FMO5P49326 533 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACOT2P49753 483 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPC3P51654 580 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 VAMP7P51809 220 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFNA5P52803 228 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 OSTNP61366 133 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYBPC2Q14324 1141 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF6Q15052 776 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBWD6Q4V339 395 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNGA4Q8IV77 575 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LILRB2Q8N423 598 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC35C1Q96A29 364 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPB2Q96IY4 423 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MNTQ99583 582 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUP58Q9BVL2 599 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms