RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 USP30Q70CQ3 517 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KDM1BQ8NB78 822 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 STK32AQ8WU08 396 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NELFBQ8WX92 580 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KAT5Q92993 513 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 BIRC7Q96CA5 298 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MED15Q96RN5 788 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 OMDQ99983 421 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CEP83Q9Y592 693 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MYH10P35580 1976 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TNFSF14O43557 240 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CALCAP01258 141 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 APOEP02649 317 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FYNP06241 537 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KRT5P13647 590 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 C21orf59P57076 290 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ECT2LQ008S8 904 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SCAPQ12770 1279 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NNTQ13423 1086 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CDH18Q13634 790 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ARID5BQ14865 1188 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TTI2Q6NXR4 508 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 BEND5Q7L4P6 421 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LGI2Q8N0V4 545 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ADAM32Q8TC27 787 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 IGSF8Q969P0 613 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC39A13Q96H72 371 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LMLNQ96KR4 655 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MTG2Q9H4K7 406 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.45□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 AKAP13Q12802 2813 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPC4 97 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LRRC72A6NJI9 287 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TTC34A8MYJ7 566 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TAF4O00268 1085 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KCNK3O14649 394 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PCDHGA12O60330 932 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SIN3BO75182 1162 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CAPNS1P04632 268 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC2A3P11169 496 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TACR2P21452 398 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC8A1P32418 973 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NNMTP40261 264 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GRK6P43250 576 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCT8P50990 548 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GALCP54803 685 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 STX17P56962 302 aa8.44□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC12A1Q13621 1099 aa8.44□□□□□ -1.06
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