RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDND1Q9NY35 253 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GDE1Q9NZC3 331 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLEC1BQ9P126 229 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCF2LO15068 1137 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DCLK1O15075 740 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLKB1P03952 638 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IRF1P10914 325 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RHOQP17081 205 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEBPBP17676 345 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MX2P20592 715 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNA5P22460 613 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TERF1P54274 439 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDH4P55283 916 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DYNLT1P63172 113 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C2orf54Q08AI8 447 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXL22Q6P050 247 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 Q6ZNB5 142 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C14orf80Q86SX3 495 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LGI2Q8N0V4 545 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ITFG1Q8TB96 612 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACTL9Q8TC94 416 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 E2F7Q96AV8 911 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OTUB2Q96DC9 234 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KRT12Q99456 494 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OBP2AQ9NY56 170 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NR2E1Q9Y466 385 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EYSQ5T1H1 3165 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFAP69A5D8W1 941 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HACD1B0YJ81 288 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LIASO43766 372 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GREM1O60565 184 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TBX10O75333 385 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDN11O75508 207 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYBBP04839 570 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ITGAVP06756 1048 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TUBBP07437 444 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBP3P10745 1247 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC6A4P31645 630 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LTBRP36941 435 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAPKAPK2P49137 400 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZXDBP98169 803 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF33AQ06730 810 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDK1Q15118 436 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NOMO1Q15155 1222 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF77Q15935 545 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MPPE1Q53F39 396 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MPP7Q5T2T1 576 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C8orf74Q6P047 294 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHST9Q7L1S5 443 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms