RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 MZB1Q8WU39 189 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SEPT8Q92599 483 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RRN3Q9NYV6 651 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 VWA8A3KMH1 1905 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CAPN15O75808 1086 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEA3P43357 314 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 BMPR2Q13873 1038 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 NUP93Q8N1F7 819 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 HIPK3Q9H422 1215 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRDP23468 1912 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 JCHAINP01591 159 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 AIF1P55008 147 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MIB1Q86YT6 1006 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GIPC2Q8TF65 315 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CABS1Q96KC9 395 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.52■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ADAM12O43184 909 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OPHN1O60890 802 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 GALTP07902 379 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HMBSP08397 361 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 INHBAP08476 426 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TPSB2P20231 275 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 DUSP4Q13115 394 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TPSAB1Q15661 275 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 C2CD2LO14523 706 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CSH1P0DML2 217 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CSH2P0DML3 217 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 EFEMP1Q12805 493 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FUT10Q6P4F1 479 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 NEU3Q9UQ49 428 aa21.51■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TYROBPO43914 113 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 VNN2O95498 520 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCL5P13501 91 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCR1P32246 355 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HCAR3P49019 387 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MYO1CO00159 1063 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ASMTLO95671 621 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 APOEP02649 317 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PARP6Q2NL67 630 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SYBUQ9NX95 663 aa21.5■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MT-ND3P03897 115 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PYGBP11216 843 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FDFT1P37268 417 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TUBP50607 506 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 NR1H3Q13133 447 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJC3Q13217 504 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF6Q15052 776 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC78A2IDD5 438 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SYN3O14994 580 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TPH1P17752 444 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 NFKB1P19838 968 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ADRA1DP25100 572 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TLE2Q04725 743 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ARTNQ5T4W7 220 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 RASIP1Q5U651 963 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 C4orf22Q6V702 233 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC6Q86X45 466 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms