RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SLC35F5Q8WV83 523 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 TFAP2BQ92481 460 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 AZIN2Q96A70 460 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SKA1Q96BD8 255 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MYO19Q96H55 970 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SLC6A18Q96N87 628 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SCUBE2Q9NQ36 999 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 RMND1Q9NWS8 449 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FTSJ1Q9UET6 329 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ITPR1Q14643 2758 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ACACAQ13085 2346 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FASNP49327 2511 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PP55 124 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPC4 97 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 M0QYV0 167 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 VILLO15195 856 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ASLP04424 464 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PAEPP09466 180 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 GALCP54803 685 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CAMK2BQ13554 666 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CNGA2Q16280 664 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 LMLNQ96KR4 655 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 OMDQ99983 421 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MIS12Q9H081 205 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 NEUROG2Q9H2A3 272 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GTQ1 180 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 LRRC72A6NJI9 287 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MID1O15344 667 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PMS1P54277 932 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 RPS24P62847 133 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CDH18Q13634 790 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CST6Q15828 149 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SLC35C1Q96A29 364 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 HSFY1Q96LI6 401 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 NT5C1BQ96P26 610 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CEP83Q9Y592 693 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 APC2O95996 2303 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PLXNA2O75051 1894 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 TRIM49BA6NDI0 452 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FBXO21O94952 628 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CALCAP01258 141 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ITGAVP06756 1048 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ABCB4P21439 1286 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SLC8A1P32418 973 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FMO5P49326 533 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 STILQ15468 1287 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FSCBQ5H9T9 825 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CFAP52Q8N1V2 620 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SERPINB11Q96P15 392 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 EBF2Q9HAK2 575 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 URB1O60287 2271 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 TTC34A8MYJ7 566 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MOCS3O95396 460 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 WNT1P04628 370 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 FYNP06241 537 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 LRRC63Q05C16 580 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 DCAF6Q58WW2 860 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 MS4A13Q5J8X5 152 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 PITRM1Q5JRX3 1037 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-214ENST00000548849 TMPRSS12Q86WS5 348 aa17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms