RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SCAPQ12770 1279 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SPARCL1Q14515 664 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PDK1Q15118 436 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DDR2Q16832 855 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RFX8Q6ZV50 586 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SCML4Q8N228 414 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IRGQQ8WZA9 623 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP36Q96G28 342 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA13Q96N96 652 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX3O60493 162 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ASMTLO95671 621 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 F9P00740 461 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CA4P22748 312 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FDFT1P37268 417 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA5AQ13591 1074 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DPYSQ14117 519 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM32Q8TC27 787 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 EDEM1Q92611 657 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 LGMNQ99538 433 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR11A4FU01 709 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TYROBPO43914 113 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PIAS1O75925 651 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GSTA2P09210 222 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 VAV1P15498 845 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA3P43357 314 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 LIG3P49916 1009 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR17Q13304 367 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DDIT4Q9NX09 232 aa20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SOAT2O75908 522 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 INHBAP08476 426 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CPB1P15086 417 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GLUD2P49448 558 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 AP1B1Q10567 949 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 C8orf48Q96LL4 319 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 H7C4K7 107 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 OPHN1O60890 802 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB14O75071 495 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZWINTO95229 277 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CPP00450 1065 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA11P43364 429 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 HCAR3P49019 387 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK16Q00536 496 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 USP41Q3LFD5 358 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 MZB1Q8WU39 189 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BADQ92934 168 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 DCLK1O15075 740 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 BAIAP3O94812 1187 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TAC1P20366 129 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 USP46P62068 366 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SCD5Q86SK9 330 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNYQ8ND76 341 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR152Q8TDT2 470 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 P2RY11Q96G91 374 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD54BQ9Y620 910 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 I6L893 689 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF103O00237 685 aa20.82■□□□□ 0.92
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