RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 EPAS1Q99814 870 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ZMYND15Q9H091 742 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 REV3LO60673 3130 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 IVLP07476 585 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CSF2RAP15509 400 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ATF6P18850 670 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PDK1Q15118 436 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TRABD2AQ86V40 505 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PPM1NQ8N819 430 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 JCHAINP01591 159 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TTC16Q8NEE8 873 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SPOCK2Q92563 424 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TTPALQ9BTX7 342 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TCEA3O75764 348 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CNTN5O94779 1100 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CCR1P32246 355 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 BMPR2Q13873 1038 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TRABDQ9H4I3 376 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TPH1P17752 444 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KRT4P19013 534 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 YWHAQP27348 245 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TUBP50607 506 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CPP00450 1065 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CXCL10P02778 98 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SPATA31D3P0C874 917 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 GMPRP36959 345 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 SEMA5AQ13591 1074 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ALFQ53S48 1182 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 MON1AQ86VX9 555 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SCML2Q9UQR0 700 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 MSH2P43246 934 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 KCNQ1P51787 676 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 GPR17Q13304 367 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTN1-205ENST00000538545 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 LRRC43Q8N309 656 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CNTD1Q8N815 330 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 SYBUQ9NX95 663 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 TBX21Q9UL17 535 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 WDR91A4D1P6 747 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN1-205ENST00000538545 E9PAM4 449 aa14.49□□□□□ -0.09
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