RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 A0A0B4J293 547 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 COQ9O75208 318 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CNTN5O94779 1100 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 C16orf89Q6UX73 402 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 GPATCH3Q96I76 525 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CXorf65A6NEN9 183 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 GOLIM4O00461 696 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KAT7O95251 611 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 UMODP07911 640 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 FCGR1AP12314 374 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP5-9P26371 169 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PEX2P28328 305 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 SLC37A1P57057 533 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PMPCAQ10713 525 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ENTPD8Q5MY95 495 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC46Q96FV0 321 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 BRINP2Q9C0B6 783 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PLSCR5A0PG75 271 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 I6L893 689 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 GLUD1P00367 558 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 TGM2P21980 687 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 MST1P26927 711 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 GLUD2P49448 558 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 IQCDQ96DY2 449 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 IL21RQ9HBE5 538 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 SCN5AQ14524 2016 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 THAP12O43422 761 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PMS2P54278 862 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 POLE2P56282 527 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 SELENOVP59797 346 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DSC1Q08554 894 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CBFBQ13951 182 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 NEURL1O76050 574 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 PDGFRBP09619 1106 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 SLC5A2P31639 672 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 EPHB1P54762 984 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 DLX5P56178 289 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 POU5F1BQ06416 359 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 LCE1FQ5T754 118 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-220ENST00000531466 TPP1O14773 563 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 DDR1Q08345 913 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 GALNT3Q14435 633 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 KRT71Q3SY84 523 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 ALG10Q5BKT4 473 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 NPIPB3Q92617 1050 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 RTP4Q96DX8 246 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 SPRY4Q9C004 299 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 KCNQ3O43525 872 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 LIASO43766 372 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 ITGB8P26012 769 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 ZP1P60852 638 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-220ENST00000531466 FAM193AP78312 1265 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.3 ms