RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527584.5

PUF60-210, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-210ENST00000527584 NAT6Q93015 286 aa8.7□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 TMEM74Q96NL1 305 aa8.7□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.7□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.7□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 SUN2Q9UH99 717 aa8.7□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.7□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.7□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 A0A1W2PQM1 296 aa8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 SLC16A4O15374 487 aa8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 RPA1P27694 616 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 UGT1A3P35503 534 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 PNPLA4P41247 253 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 26.9
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PUF60-210ENST00000527584 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.69□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 KLKB1P03952 638 aa8.68□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 CAPN3P20807 821 aa8.68□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 GUCY2CP25092 1073 aa8.68□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 SLC8A1P32418 973 aa8.68□□□□□ -1.02
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PUF60-210ENST00000527584 CSF2P04141 144 aa8.67□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 PRKAR1AP10644 381 aa8.67□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 MUTP22033 750 aa8.67□□□□□ -1.02
PUF60-210ENST00000527584 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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