RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526865.5

RRM1-204, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 4

Gene RRM1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-204	ENST00000526865	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865		A0A096LPE4	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CLDN5	O00501	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	IKBKB	O14920	756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GJB3	O75712	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	VNN1	O95497	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CER1	O95813	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	EGF	P01133	1207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	P4HA1	P13674	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	EDN3	P14138	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CD58	P19256	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	BCKDHB	P21953	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	BDNF	P23560	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GABRR2	P28476	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ATIC	P31939	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GRIK1	P39086	918 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CCR2	P41597	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ZACN	Q401N2	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	FGF11	Q92914	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CD101	Q93033	1021 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MYH11	P35749	1972 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	GABRD	O14764	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TNFSF14	O43557	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	STX10	O60499	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF217	O75362	1048 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	MOSPD3	O75425	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	TIAF1	O95411	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRM1-204	ENST00000526865	SFTPC	P11686	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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