RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM10Q9UDY6 481 aa19.29■□□□□ 0.68
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PTPRK-218ENST00000525459 TMEM248Q9NWD8 314 aa19.26■□□□□ 0.67
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PTPRK-218ENST00000525459 AMFRQ9UKV5 643 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRK-218ENST00000525459 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
PTPRK-218ENST00000525459 VCANP13611 3396 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRK-218ENST00000525459 WASH4PA8MWX3 477 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRK-218ENST00000525459 FAM72CH0Y354 149 aa19.25■□□□□ 0.67
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