RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEH1Q9H213 219 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1B0GUV1 79 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CXorf65A6NEN9 183 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 F8W8V4 182 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP6R2O75170 966 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTN5O94779 1100 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLUD1P00367 558 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDGFRBP09619 1106 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCGR1AP12314 374 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARSBP15848 533 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TGM2P21980 687 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLUD2P49448 558 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASSF2P50749 326 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPHB1P54762 984 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAF1Q13077 416 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG10Q5BKT4 473 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT2AQ92830 837 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WZ62 844 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0B4J293 547 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIASO43766 372 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCATP04180 440 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC37A1P57057 533 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM193AP78312 1265 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABATP80404 500 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FSCBQ5H9T9 825 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf89Q6UX73 402 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMC9Q7Z3E5 817 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTP4Q96DX8 246 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPATCH3Q96I76 525 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0QZQ0 153 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPP1O14773 563 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R3DO95685 299 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 IDEP14735 1019 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MST1P26927 711 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF5AQ12840 1032 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC39A14Q15043 492 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCB4Q15147 1175 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLFQ16534 295 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FJX1Q86VR8 437 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF3BO15066 747 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC16A5O15375 505 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNQ3O43525 872 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT7O95251 611 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 VIPP01282 170 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC5A2P31639 672 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PMS2P54278 862 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZP1P60852 638 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms