RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FAAP100Q0VG06 881 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 RNF34Q969K3 372 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NMUR1Q9HB89 426 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GOLGA8RI6L899 631 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ENPP3O14638 875 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 INHBAP08476 426 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ELF1P32519 619 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GPR15P49685 360 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 VEGFBP49765 207 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IL9RQ01113 521 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GALNT2Q10471 571 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TCTN1Q2MV58 587 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CASP10Q92851 521 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SH3GL3Q99963 347 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.074e-6■□□□□ 8.8
SH3BP2-229ENST00000515802 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 HCSTQ9UBK5 93 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SNX3O60493 162 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FKTNO75072 461 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 MLNP12872 115 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 APLP1P51693 650 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CRADDP78560 199 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PARP6Q2NL67 630 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ARTNQ5T4W7 220 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRC6Q86X45 466 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PPM1NQ8N819 430 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 BANPQ8N9N5 519 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 HDAC11Q96DB2 347 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SERAC1Q96JX3 654 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 B3GALT6Q96L58 329 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 OSER1Q9NX31 292 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 A0A1W2PQH9 124 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NCAM2O15394 837 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UGT1A9O60656 530 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TADA2AO75478 443 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GSTA2P09210 222 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 COL6A1P12109 1028 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SPARCL1Q14515 664 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DDR2Q16832 855 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CGB2Q6NT52 195 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM74Q86UV6 250 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIM73Q86UV7 250 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SPOCK2Q92563 424 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CASD1Q96PB1 797 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 WDR27A2RRH5 827 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SYN3O14994 580 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CSH1P0DML2 217 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CSH2P0DML3 217 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ZBTB17Q13105 803 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms