RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM129BQ96TA1 746 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.9■□□□□ 0.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1W2PP55 124 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MID1O15344 667 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 YEATS4O95619 227 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VAMP7P51809 220 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CXADRP78310 365 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RHDQ02161 417 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KCNH2Q12809 1159 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OXR1Q8N573 874 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TTC39CQ8N584 583 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AZIN2Q96A70 460 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.89■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TULP2O00295 520 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IRAK2O43187 625 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ASLP04424 464 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NFIL3Q16649 462 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF394Q53GI3 561 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQCHQ86VS3 1027 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AADATQ8N5Z0 425 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPTA1P02549 2419 aa20.88■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 E7ENQ6 273 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GOT1P17174 413 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC6A4P31645 630 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC8A1P32418 973 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GCLMP48507 274 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADPRHP54922 357 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 E2F1Q01094 437 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SERAC1Q96JX3 654 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CISHQ9NSE2 258 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.87■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OVGP1Q12889 678 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GANCQ8TET4 914 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TTC9Q92623 222 aa20.86■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 B8ZZF3 427 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBL1XO60907 577 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MT-CO3P00414 261 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CSKP41240 450 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AFMP43652 599 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UCNP55089 124 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ST8SIA6P61647 398 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP135Q66GS9 1140 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC25A45Q8N413 288 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF139Q8WU17 664 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EDEM1Q92611 657 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SEMA4DQ92854 862 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OMDQ99983 421 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.85■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM38O00635 465 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM49P0CI25 452 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM49CP0CI26 452 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C5AR1P21730 350 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GTF2H1P32780 548 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DRD3P35462 400 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC8A3P57103 927 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMPRSS3P57727 454 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.84■□□□□ 0.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RESP18Q5W5W9 173 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms