RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV3-19	P01714	112 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHX1	P07099	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDHB	P21912	280 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCR1	P32246	355 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLT3	P36888	993 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	GGCX	P38435	758 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSK	P41240	450 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MATK	P42679	507 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRX4	P78413	519 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDR2	Q01850	454 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	STARD3	Q14849	445 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	APCDD1	Q8J025	514 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGK	Q92643	395 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTG2	Q9H4K7	406 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QYT0	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX33	O43247	280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP3K13	O43283	966 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAGE1	O75459	146 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADCY5	O95622	1261 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCR3	P49682	368 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPMT	P51580	245 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPC	Q03188	943 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBXN1	Q04323	297 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NME3	Q13232	169 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T3	Q8NH03	318 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG14	Q96F25	216 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBCB	Q99426	244 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31	9e-6	■■■■□ 24.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		F5H5T6	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP5Z1	O43299	807 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A3	P11169	496 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCB4	P21439	1286 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP8	P22894	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD6	P30203	668 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SULT1E1	P49888	294 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX16	P57768	344 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXK2	Q01167	660 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH18	Q13634	790 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F5	Q15329	346 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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