RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 IQCDQ96DY2 449 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SUN2Q9UH99 717 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GVM2 712 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 FLT3P36888 993 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 P2RY2P41231 377 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 LMAN2Q12907 356 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ENPP2Q13822 863 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL22Q6P050 247 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 BAP1Q92560 729 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ACADMP11310 421 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NNMTP40261 264 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP11AP98196 1134 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FIGNQ5HY92 759 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 EMC1Q8N766 993 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RLN3Q8WXF3 142 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC17Q96AE7 1141 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf74Q96LT6 269 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPY26PQ9H489 355 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CLDN11O75508 207 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 EPN2O95208 641 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ADCY5O95622 1261 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFV2P19404 249 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CSKP41240 450 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SULT2A1Q06520 285 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CDO1Q16878 200 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FUT11Q495W5 492 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C3orf20Q8ND61 904 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 HAPLN3Q96S86 360 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNKQ9P0W0 207 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DMDP11532 3685 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 AP5Z1O43299 807 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFS2O75306 463 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SDHBP21912 280 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CREB5Q02930 508 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LMNB2Q03252 620 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CSRP2Q16527 193 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FSCBQ5H9T9 825 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS36Q86VN1 386 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FBRSQ9HAH7 460 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CBFA2T2O43439 604 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ENDOD1O94919 500 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 GPD1P21695 349 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKCHP24723 683 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN9P43378 593 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH4P55283 916 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP8P85298 464 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ECT2LQ008S8 904 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PTP4A2Q12974 167 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms