RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497146.5

PTGER3-211, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,971 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-211ENST00000497146 CFAP36Q96G28 342 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SCLYQ96I15 445 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 TOX2Q96NM4 488 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 GRIA1P42261 906 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 GPR17Q13304 367 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 CCNJLQ8IV13 435 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 CASP10Q92851 521 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 NMUR1Q9HB89 426 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-211ENST00000497146 SPAG7O75391 227 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PAGE1O75459 146 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 GALTP07902 379 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PID1Q7Z2X4 250 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 LZTR1Q8N653 840 aa22.14■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TYROBPO43914 113 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PTPN3P26045 913 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 HOXC13P31276 330 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TCTN1Q2MV58 587 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TTPALQ9BTX7 342 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 CEP41Q9BYV8 373 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SIK2Q9H0K1 926 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 COMMD8Q9NX08 183 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 IL37Q9NZH6 218 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 FAM92AA1XBS5 289 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 KCNK1O00180 336 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 APOEP02649 317 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 KRT4P19013 534 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PRKCHP24723 683 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PSMB4P28070 264 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 CCL23P55773 120 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ARPP19P56211 112 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 LRRC6Q86X45 466 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MPP5Q8N3R9 675 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 GDAP1Q8TB36 358 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SPATA17Q96L03 361 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MAGEB18Q96M61 343 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 NAT9Q9BTE0 207 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MTMR11A4FU01 709 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ASMTLO95671 621 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 YWHAQP27348 245 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 GPR15P49685 360 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 IL9RQ01113 521 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 FAAP100Q0VG06 881 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 RTP2Q5QGT7 225 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 F5H423 210 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 LGSNQ5TDP6 509 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 MANEALQ5VSG8 457 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 FBXO32Q969P5 355 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 B3GALT6Q96L58 329 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 C1orf74Q96LT6 269 aa22.11■■□□□ 1.13
PTGER3-211ENST00000497146 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms