RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 HBP1O60381 514 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM11O75078 769 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GAP43P17677 238 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GNA11P29992 359 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ALDH1A3P47895 512 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNG1P51959 295 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GPX6P59796 221 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4F2P78329 520 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MPP1Q00013 466 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT76Q01546 638 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4F3Q08477 520 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC3Q13217 504 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RIPK1Q13546 671 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 UGP2Q16851 508 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 XKR3Q5GH77 459 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO27Q8NI29 283 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DTLQ9NZJ0 730 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 VAV3Q9UKW4 847 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NEDD4P46934 1319 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HEATR9A2RTY3 570 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM77I1YAP6 450 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD11O00231 422 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 AP3D1O14617 1153 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR37O15354 613 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GPC4O75487 556 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PALMO75781 387 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PIAS2O75928 621 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT75O95678 551 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CPA3P15088 417 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TYRP1P17643 537 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RCVRNP35243 200 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HNF4AP41235 474 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ5P48544 419 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GALK1P51570 392 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 STAT5BP51692 787 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 AP3B2Q13367 1082 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GIT2Q14161 759 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ADRM1Q16186 407 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf88Q6PI97 169 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNJLQ8IV13 435 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS39Q96JC1 886 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TM9SF2Q99805 663 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SHOXO15266 292 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT86O43790 486 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGN1P05114 100 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 POLBP06746 335 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CHN1P15882 459 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MARK3P27448 753 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GSSP48637 474 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SPAG1Q07617 926 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 XKR9Q5GH70 373 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR73Q6P4I2 378 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235.7 ms