RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 MGARPQ8TDB4 240 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 EDEM1Q92611 657 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PAFAH2Q99487 392 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TTLL3Q9Y4R7 772 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 RAD54BQ9Y620 910 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 LTBP2Q14767 1821 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TNFRSF10BO14763 440 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 10.8
TNS1-217ENST00000490566 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ERCC2P18074 760 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 OR1G1P47890 313 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 IFNAR2P48551 515 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CDK7P50613 346 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TPI1P60174 286 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 MTM1Q13496 603 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 BSPRYQ5W0U4 402 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 MZB1Q8WU39 189 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 DCAKDQ8WVC6 231 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 LRRC39Q96DD0 335 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 LGMNQ99538 433 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TRABDQ9H4I3 376 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 HTTP42858 3142 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 RNF103O00237 685 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 OPHN1O60890 802 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 NBNO60934 754 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 AVILO75366 819 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 OAZ2O95190 189 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 C1QAP02745 245 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 APRTP07741 180 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 GSTA2P09210 222 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SLC5A3P53794 718 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SLC18A1P54219 525 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 LRRC14Q15048 493 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ARHGEF6Q15052 776 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SLC39A12Q504Y0 691 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 MICALCLQ6ZW33 695 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 P2RY11Q96G91 374 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CYTH2Q99418 400 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 FAM169AQ9Y6X4 670 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 KIAA1671Q9BY89 1806 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PCNTO95613 3336 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 FAM47DPA6NHR8 397 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SYN3O14994 580 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 IRAK2O43187 625 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 OR4Q2P0C623 313 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 KRT15P19012 456 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 STX2P32856 288 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CYP2C18P33260 490 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 MSH2P43246 934 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 VEGFBP49765 207 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CDK16Q00536 496 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 AP1B1Q10567 949 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 WASHC5Q12768 1159 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 BFSP2Q13515 415 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 GPNMBQ14956 572 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 NETO2Q8NC67 525 aa10.66□□□□□ -0.7
TNS1-217ENST00000490566 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms