RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490203.5

ELF3-208, Transcript of E74 like ETS transcription factor 3, human

TSL 5

Gene ELF3, Length 885 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELF3-208	ENST00000490203	TJP3	O95049	919 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	NFATC1	O95644	943 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FCAR	P24071	287 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	SLC6A4	P31645	630 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PTPN7	P35236	360 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CDKN2B	P42772	138 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	HCAR3	P49019	387 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TBL1X	O60907	577 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ADH1C	P00326	375 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	KRT10	P13645	584 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RHOQ	P17081	205 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PSMC3	P17980	439 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	AMPD1	P23109	780 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	DYNLT1	P63172	113 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	NR1H3	Q13133	447 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	DPYS	Q14117	519 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	GRM2	Q14416	872 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TSC1	Q92574	1164 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	BHMT	Q93088	406 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203		A0A1B0GVM2	712 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF185	O15231	689 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CST8	O60676	142 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CLDN11	O75508	207 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FGG	P02679	453 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ERCC2	P18074	760 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	HOXC13	P31276	330 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	SERPINB6	P35237	376 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CDH4	P55283	916 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	AMPD2	Q01433	879 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	HTR4	Q13639	388 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ANO4	Q32M45	955 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	FGF14	Q92915	247 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ELF3-208	ENST00000490203	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.79	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms