RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, human

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-210	ENST00000489475	GBF1	Q92538	1859 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475		H3BNC9	293 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	ARTN	Q5T4W7	220 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	C4orf22	Q6V702	233 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
HOXB3-210	ENST00000489475	PPFIA2	O75334	1257 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC11A2	P49281	568 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	DONSON	Q9NYP3	566 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MPP6	Q9NZW5	540 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CLUH	O75153	1309 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	C5orf60	A6NFR6	353 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CCL16	O15467	120 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GCAT	O75600	419 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PBX2	P40425	430 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GALNT2	Q10471	571 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SLMAP	Q14BN4	828 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC25	Q86WR0	208 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CHSY1	Q86X52	802 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TMC8	Q8IU68	726 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		27.57	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	VAV1	P15498	845 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	FBXL22	Q6P050	247 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GAREM2	Q75VX8	874 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	P2RY11	Q96G91	374 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GCNA	Q96QF7	691 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	LRRC3	Q9BY71	257 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ASAH2	Q9NR71	780 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GKN1	Q9NS71	199 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		27.56	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	WASH4P	A8MWX3	477 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ACSL4	O60488	711 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	STC2	O76061	302 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RHOQ	P17081	205 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CDC25C	P30307	473 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HDAC11	Q96DB2	347 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CORO1B	Q9BR76	489 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	KLC2	Q9H0B6	622 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HDC	P19113	662 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TXNDC8	Q6A555	127 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CPT1B	Q92523	772 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	AZIN2	Q96A70	460 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	PBX4	Q9BYU1	374 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		27.55	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SMAP	O00193	183 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	TACR2	P21452	398 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HSD17B3	P37058	310 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CFAP58	Q5T655	872 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ALS2CL	Q60I27	953 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	HOOK3	Q86VS8	718 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	DENND1C	Q8IV53	801 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	GDF15	Q99988	308 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	CERS4	Q9HA82	394 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		27.54	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475		A0A0A0MRY4	1105 aa		27.53	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475		F5H5T6	163 aa		27.53	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	RNF103	O00237	685 aa		27.53	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	MTSS1	O43312	755 aa		27.53	■■■□□ 2
HOXB3-210	ENST00000489475	IRF1	P10914	325 aa		27.53	■■■□□ 2

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