RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERINC5Q86VE9 423 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DTLQ9NZJ0 730 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT4O43236 478 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENDOD1O94919 500 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM200BP0CF97 657 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AXLP30530 894 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RCN2Q14257 317 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM35AQ86V20 835 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYLPFQ96A32 169 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOL2Q9BQE5 337 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBP1Q9NZI7 540 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.96■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E7ESA3 106 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAUS5O94927 633 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYL2P10916 166 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARPP19P56211 112 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS15P98073 1019 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC42EP1Q00587 391 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEUP1Q05D60 604 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUL3Q13618 768 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNJ11Q14654 390 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR4Q5GH76 650 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCEL1Q9H607 264 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDIT4Q9NX09 232 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.95■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MATKP42679 507 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB4P48594 390 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR15P49685 360 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGA7Q13683 1181 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STILQ15468 1287 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF276Q8N554 614 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALADP13716 330 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCG1P45844 678 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SREBF2Q12772 1141 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPH3Q86UC2 560 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP33Q8TEY7 942 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOPT1Q96IL0 206 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIPEPQ99797 713 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLC2Q9H0B6 622 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO7AQ13402 2215 aa15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSH1P0DML2 217 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSH2P0DML3 217 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXC8P31273 242 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNPLA4P41247 253 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGGT1BP53609 377 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAK5Q9P286 719 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2CD2LO14523 706 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TM9SF1O15321 606 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBTPS1Q14703 1052 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UPP1Q16831 310 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO7Q6IWH7 933 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf46Q6P387 395 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS52Q8N1B4 723 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF34Q969K3 372 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDC80O14777 642 aa15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTA1Q13330 715 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms