RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-208ENST00000485792 C10orf142B7Z368 130 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 THAP12O43422 761 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 TULP3O75386 442 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 WFS1O76024 890 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 ABL1P00519 1130 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 ADH5P11766 374 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 MMP8P22894 467 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SOX5P35711 763 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 CHKAP35790 457 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 PRKCIP41743 596 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 GRIA2P42262 883 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 NUMBP49757 651 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 CDR2Q01850 454 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SLC6A3Q01959 620 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 KDSRQ06136 332 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 LRRC32Q14392 662 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 ADGRF1Q5T601 910 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 RASSF3Q86WH2 238 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 RNF217Q8TC41 542 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 MYO19Q96H55 970 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.95□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 A0A1W2PQF6 199 aa5.94□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 A6NJY4 79 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SGK1O00141 431 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 IRAK2O43187 625 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 HSF2BPO75031 334 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 GRAP2O75791 330 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 KAT7O95251 611 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 HMBSP08397 361 aa5.94□□□□□ -1.46
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CUX1-208ENST00000485792 GEN1Q17RS7 908 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 TAF3Q5VWG9 929 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.94□□□□□ -1.46
CUX1-208ENST00000485792 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.94□□□□□ -1.46
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