RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 NNMTP40261 264 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TMEM110Q86TL2 294 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 RNF34Q969K3 372 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TTC17Q96AE7 1141 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A13Q96H72 371 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.933e-20■■■■□ 20.1
ACTB-212ENST00000484841 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FSBPO95073 299 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A3P11169 496 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CDK17Q00537 523 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PTK2Q05397 1052 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PDCLQ13371 301 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 DCAF6Q58WW2 860 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 WASF3Q9UPY6 502 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ACACBO00763 2458 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 GJB3O75712 270 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ZNF883P0CG24 379 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SLC9A1P19634 815 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ABCB4P21439 1286 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TACR2P21452 398 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 HLA-BQ31612 363 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 GJB7Q6PEY0 223 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 USP30Q70CQ3 517 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 MLKLQ8NB16 471 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 KDM1BQ8NB78 822 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 OMDQ99983 421 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SYNCQ9H7C4 482 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 COX16Q9P0S2 106 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GVT2 93 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SIN3BO75182 1162 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 GLI1P08151 1106 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CCR1P32246 355 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 KRT9P35527 623 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FAM193AP78312 1265 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ECT2LQ008S8 904 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 BIRC7Q96CA5 298 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ACP6Q9NPH0 428 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CACNA1BQ00975 2339 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 HSF2BPO75031 334 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CD27P26842 260 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 OXCT1P55809 520 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 MTA1Q13330 715 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SLC12A1Q13621 1099 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 FSCBQ5H9T9 825 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 PASD1Q8IV76 773 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 DEFB106AQ8N104 65 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 SKA1Q96BD8 255 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 MTG2Q9H4K7 406 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 DDIT4Q9NX09 232 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 KLK13Q9UKR3 277 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-212ENST00000484841 LRRC72A6NJI9 287 aa20.82■□□□□ 0.92
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