RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HSD17B4P51659 736 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NEK2P51955 445 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PIGFQ07326 219 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MCL1Q07820 350 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRAF1Q13077 416 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R5AQ15172 486 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT17Q6IS24 598 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DPP9Q86TI2 863 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 Q8NA96 180 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TMIEQ8NEW7 156 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf48Q96LL4 319 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MROH8Q9H579 483 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LCTP09848 1927 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PLXNB2O15031 1838 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FAM86B1E9PN63 330 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC37A4O43826 429 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FAM86B2P0C5J1 330 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ARP10275 920 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK4P31152 587 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FOLR3P41439 243 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TBX4P57082 545 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SP3Q02447 781 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PGM5Q15124 567 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 STK38Q15208 465 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 SPECC1Q5M775 1068 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ANO1Q5XXA6 986 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NEK8Q86SG6 692 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TTC7BQ86TV6 843 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MIER2Q8N344 545 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FAM133AQ8N9E0 248 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PDPRQ8NCN5 879 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO40Q9UH90 709 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA2Q9UL42 364 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MCM3APO60318 1980 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PFASO15067 1338 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PCNTO95613 3336 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CEP350Q5VT06 3117 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WWV3 80 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC15A5A6NIM6 579 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TSPAN6O43657 245 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 STRNO43815 780 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ATP9AO75110 1047 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV2-14P01704 120 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CDC25AP30304 524 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2C19P33261 490 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 COPB2P35606 906 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RAB27AP51159 221 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CACNA2D1P54289 1103 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MC2RQ01718 297 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GHRHRQ02643 423 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PRKCZQ05513 592 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GRB14Q14449 540 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IL17AQ16552 155 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.25□□□□□ -1.57
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